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代替“深蓝”的“蓝色基因”初具规模

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从1999年以来,IBM公司就一直在研发代替深蓝(Deep Bule)”的超级计算机,并为它起名为“蓝色基因(Blue Gene)”。最近有消息称,IBM调整了该计划,将原计划分为三个阶段,并且第一阶段的蓝色基因目前已经开始测试。

蓝色基因采用的是大规模并行计算的方式,共拥有3.6万个处理器,每秒可以进行1千兆次浮点运算。据称,该计算机可以帮助科学家模拟蛋白质折叠(protein folding),以便研发新药。在研发初期,IBM公司计划用5年时间完成这一计划,但现在,在研发的第4年中,计划已经做出了一些调整。

由于IBM公司希望将蓝色基因建成一台商业目的的超级计算机,所以目前,该公司将其分为两个不同的架构。其中的第一个被称为Blue Gene/C,这是IBM按照当初的计划而设计的,而另一个则被称为Blue Gene/L,它是一个新的设计,将用于一般用途,它将简化结构,每秒大约进行1/3千兆次浮点运算,如果一切正常的话,它将在2004年问世。

上述改变并不意味着IBM公司降低了自己的预期,IBM蓝色基因计划的负责人Bill Pulleyblank表示:“我们希望将Blue Gene/L作为整个进程中的一步,它是一个谨慎的选择。”他还表示,每秒进行1/3千兆次浮点运算已经是目前世界上500台最快的计算机的运算速度之和了。

Blue Gene/L是IBM公司与位于美国加利福尼亚州的Lawrence Livermore国家实验室合作开发的,它将作为“蓝色基因”的某些技术的测试机。需要特别说明的是,它还将为IBM测试“信息传递(message-passing)”计划, 该计划将用于将信息从一个处理器传输到另一个处理器。在拥有数以万计的处理器的计算机中,瓶颈并非是缺乏计算能力,而是每一个处理器如何得到它所需信息的能力。

基于Blue Gene/L的运行状况,IBM将制定下一步的计划,并将在Blue Gene/C和Blue Gene/L的基础上,建立一台运算速度更快的计算机――Blue Gene/P。这台计算机才是将用于模拟蛋白质折叠的超级计算机。其建成时间虽迟于预期,但是运行速度却会提高,将比Blue Gene/L快3倍,Blue Gene/P的速度可能会达到每秒几千兆次浮点运算。

Blue Gene/L将包括6.6万个处理器,每一个处理器将包括IBM PowerPC 440GX处理器的两个核心,此外还加入了浮点运算单元来加快运算速度,并且还具有处理器内建的存储器,该计算机将运行Linux操作系统。蓝色基因的处理器之间将采用5个重叠的网络进行连接,其中包括椭圆型网络和树状网络。这样,就形成了由1024个节点构成的、每个节点附带64个处理器的Linux“集群”。这使得Blue Gene/L与目前的Linux集群计算机非常相似,比较容易进行编程,Pulleyblank 博士认为,Linux的迅速发展刚好与蓝色基因计划同步,这给该计划带来了极大的促进。