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革兰阴性杆菌产超广谱β?内酰胺酶的分布及基因型

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作者:孟灵 张润玲 尤崇革 王应芳

【摘要】

目的: 了解临床分离的革兰阴性杆菌中产ESBLs的流行特征及ESBLs基因型. 方法: 对我院临床分离的革兰阴性杆菌,采用改良三维试验检测产 ESBLs 菌株,用PCR对 ESBLs 基因进行分型. 结果: 175株革兰阴性杆菌分离出49株产ESBLs 菌,阳性率28%,包括大肠埃希菌、克雷伯菌属、阴沟肠杆菌、弗劳地枸椽酸杆菌、铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌. 其中,第一位是阴沟肠杆菌(34.7%,17/49),其次是大肠埃希菌(30.6%,15/49). 每种细菌产ESBLs率前三位是阴沟肠杆菌(56.6%,17/30),大肠埃希菌(37.5%,15/40),肺炎克雷伯菌(25.0%,6/24). 各病区中神经科产ESBLs菌分离率最高(32.7%). 49株产ESBLs 菌携带TEM, SHV, CTX?M分别为34,5,16株,有17株同时携带两种β?内酰胺酶基因的菌株,占34.7%, 其中TEM+CTX?M型13株,占基因双阳性菌株的76.5%. 结论: 我院产ESBLs菌以阴沟肠杆菌、大肠埃希菌为主. 神经科是主要产ESBLs菌的病区. ESBLs基因以 TEM 型、CTX?M 型为主,携带双基因的菌株在我院有流行.

【关键词】 革兰阴性杆菌 β?内酰胺酶类 三维试验 基因型

0引言

广谱β?内酰胺酶( Extended?spectrum beta?lactamases, ESBLs)是质粒介导的由β?内酰胺酶(BLA)基因突变而形成的一类酶,是丝氨酸蛋白酶的衍生物. 它可水解头孢噻肟(CTX),头孢他啶(CAZ)等三代头孢菌素和单环酰胺类抗生素,并可被β?内酰胺酶抑制剂(如克拉维酸)抑制[1]. 自1983年德国首次从臭鼻克雷伯杆菌中分离出SHV?2基因型ESBL以来,其数量及种类已在世界各地迅速增长. ESBLs基因型主要分为SHV,TEM,CTX?M,OXA型和其他型,目前已发现200多种( /studies/webt.htm). 不同的国家、地区、医院因其使用抗生素的种类和剂量不同,产ESBLs细菌的检出率、耐药性、基因型也有所差异. 为了解兰州大学第二医院革兰阴性杆菌产ESBLs的流行状况和基因分型,我们对49株革兰阴性杆菌进行了ESBLs的确认及其基因型测定.

1材料和方法

1.1材料头孢噻肟(CTX,30 μg/片),头孢硝噻吩纸片(Nitrocefin),M?H琼脂购自英国Oxiod公司;克拉维酸(山西威奇达药业有限公司), 氯唑西林(山西博康药业有限公司 );TaKaRa质粒DNA纯化盒,TaKaRa PCR 扩增盒, DNA Marker D3405A,引物购自宝生物(大连)有限公司. PCR分析仪(美国PERKIN ELMER),凝胶成像仪(德国Herolab),ABI DNA 测序仪(美国PE),电泳仪(北京六一仪器厂). 大肠埃希菌ATCC 25922、肺炎克雷伯菌700603(卫生部临检中心). 2005?05~09我院临床分离菌175株革兰阴性杆菌.

1.2方法

1.2.1改良三维试验对待测菌株利用冻融法获取粗酶提取液,滤菌器过滤后测定β?内酰胺酶呈阳性待用. 将CTX纸片贴于涂布了大肠埃希菌ATCC 25922的M?H平板中央,具其5 mm处用刀片向外分别切四个裂隙,在各裂隙中分别加入待测粗酶液(30 μL),粗酶液(30 μL)+克拉维酸液(2 mmol/L 10 μL),粗酶液(30 μL)+氯唑西林液(2 mmol/L 10 μL),粗酶液(30 μL)+克拉维酸液(2 mmol/L 10 μL)+氯唑西林液(2 mmol/L 10 μL),35℃过夜培养.

1.2.2ESBLs基因型酶(TEM, SHV, CTX?M?1型)PCR扩增 ① 引物设计: TEM型 T1(5′?ATA AAA TTC TTG AAG ACG AAA?3′),T2(5′?GAC AGT TAC CAA TGC TTA ATC A?3′), 终产物1075 bp;SHV型S1(5′?GGG TTA TTC TTA TTT GTC GC?3′),S2( 5′?TTA GCG TTG CCA GTG CTC?3′), 终产物928 bp;CTX?M?1型C1( 5′?GGC CCA TGG TTA AAA AAT CAC TGC?3′),C2(5′?CCG TTT CCG CTA TTA CAA ACC GTC G?3′) 终产物826 bp. ② 质粒提取:挑选待测菌单个菌落接种至2.5 mL含有氨苄西林(50 mg/L)的LB培养基35℃过夜培养,经23 000 g离心2 min,沉淀物采用碱裂解法提取质粒DNA. ③ 反应体系: 引物各0.25 μL, 10×PCR Buffer(+)(Mg2+PLus)5 μL,dNTP 4 μL,Taq酶0.25 μL,质粒模板2 μL,加去离子水至50 μL. ④ 反应参数:TEM型 变性94℃ 45 s,退火50℃ 45 s,延伸72℃ 1 min共30个循环;SHV型 变性94℃ 30 s,退火55℃ 30 s,延伸72℃ 1 min共30个循环;CTX?M型 变性94℃ 45 s,退火59℃ 45 s,延伸72℃ 1 min共30个循环.

1.2.3PCR产物测序PCR产物送宝生物(大连)有限公司,采用Sanger双脱氧链终止法测序,结果直接在GenBank中(www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST)进行序列比对分析.

1.2.4PCR产物聚丙烯酰胺凝胶电泳PCR产物点样于40 g/L聚丙烯酰胺凝胶,以8 V/cm的电压下进行电泳30 min后,经0.5 mg/L溴化乙锭染色,凝胶置于凝胶成像仪摄像.

2结果

2.1产ESBLs革兰阴性杆菌的菌株分布175株临床分离菌株检出49株ESBLs表型阳性菌,阳性率28%. 产ESBLs菌株中,最常见的是阴沟肠杆菌,其次是大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌,最少见的是弗劳地枸橼酸菌(表1). 各类革兰阴性杆菌产ESBLs率最高为阴沟肠杆菌,其次是大肠埃希菌、克雷伯菌属,铜绿假单胞菌产ESBLs率最低. 表1革兰阴性杆菌产ESBLs的分离率

2.2产ESBLs革兰阴性杆菌的科室分布产ESBLs菌在医院各科室广泛存在,神经科中比例最高,达32.7%(表2). 表249株产ESBLs菌的病区分布

2.3产ESBLs革兰阴性杆菌基因分型携带TEM型β?内酰胺酶基因的菌株为34株(69.3%),携带SHV型、CTX?M型基因的菌株分别为5株(10.2%)、16株(34.7%),其他型别11株(22.4%). 其中,有17株同时携带两种β?内酰胺酶基因的菌株,占34.7%,TEM+CTX?M型13株(26.5%),TEM+SHV型3株(10.2%),SHV型+CTX?M1株(2.0%). 各型PCR扩增产物电泳见图1,菌株详细ESBL基因分型.

3讨论

产ESBLs菌株主要引起医院感染和流行. 从对本院的研究表明,我院产ESBLs菌分布范围广,分离率高. 其中所占比例最高的是阴沟肠杆菌(34.7%),其次是大肠埃希菌(30.6%). 近年来,我国各地区产ESBLs大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌分离率,一般在15%~35%左右[2],2003年以来,部分城市已高达40%[3]. 本研究产ESBLs大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌的分离率分别是37.5%, 25%,与全国水平相当. 各地区对产ESBLs阴沟肠杆菌的分离率差异较大,佘丹阳等[4]在106株阴沟肠杆菌中发现单纯产ESBLs占10.4%(11/106),肖庆忠等[5]报告阴沟肠杆菌产ESBLs达55.2%(117/212),本院阴沟肠杆菌产ESBLs率高达56.6%,与广州地区相似,可能与本院菌株分布,用药种类不同或存在局部流行有关.

我院多个科室中均分离到ESBLs菌,表明全院面临产ESBLs菌感染的威胁,应引起高度重视. 其中,ESBLs菌在神经科最常见(32.7%). 推测原因神经科入住的危重患者多,第三代头孢菌素使用量较大,在抗生素的选择性压力下,导致了ESBLs产生株增多.

PCR结果表明本院产ESBLs革兰阴性杆菌主要产TEM型β?内酰胺酶,以大肠埃希菌和阴沟肠杆菌为主,其次是CTX?M型,主要集中于阴沟肠杆菌. 本院SHV型β?内酰胺酶少见,主要由克雷伯菌属产生. 产TEM型、CTX?M型β?内酰胺酶在鲍曼不动杆菌检出,但不排除存在其他型别的可能. 李蓉等[6]检测15株鲍曼不动杆菌主要为 TEM 型、PER 型β? 内酰胺酶基因和 OXA?23 型碳青霉烯酶基因. 本研究中三株铜绿假单胞菌均不含blaTEM, blaSHV, blaCTX,说明可能为其他型别,有待进一步研究. 有报道,铜绿假单胞菌最常见为PER型[3]. 值得关注的是,本院产ESBLs菌TEM, SHV, CTX基因双阳性的比率达34.7%,表明产ESBLs菌携带两种β? 内酰胺酶耐药基因是我院的流行特点. 其中,阴沟肠杆菌TEM型和CTX?M型阳性占52.9%(17/9),多个耐药基因的存在造成阴沟肠杆菌的耐药谱扩大[7]. 北京张永利等[8]在12株阴沟肠杆菌中检出5株同时携带blaTEM, blaCTX,推测产 ESBLs 菌可通过质粒进行细菌间耐药基因的交换,同一菌株质粒上有2种或2种以上ESBLs编码基因.

本研究我们发现CTX?M型β?内酰胺酶在我院有流行,具有重要的意义. 国内报道产ESBLs的大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌的基因型主要是CTX?M型[9],与我国头孢噻肟用量多于其他三代头孢菌素有关. 我院头孢噻肟的用量也有此特点. CTX?M型ESBLs菌株可通过转座子从染色体转移至质粒,并通过质粒使耐药性广泛传播,从而存在爆发流行的潜在性. 因此,临床要避免滥用抗生素,重视细菌耐药的检测,控制耐药菌株的传播,减少医院感染的发生.

【参考文献】

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[4] 佘丹阳,刘又宁.AmpC酶和超广谱?β内酰胺酶在阴沟肠杆菌中的表达及其耐药性的影响[J].中华医学杂志,2002,2:211-214.

[5] 肖庆忠,苏丹虹,江洁华,等. 广州地区3 500株革兰阴性杆菌TEM和SHV型超广谱β?内酰胺酶基因分型研究[J].中华检验医学杂志,2005,28(10):1010-1014.

[6] 李蓉,李文林,石小玉,等,产ESBLs鲍曼不动杆菌的耐药特性、质粒谱及耐药基因型[J]. 中国抗生素杂,2006,31(4):202-205.

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[8] 张永利,顾怡明,张杰,等. 多重耐药阴沟肠杆菌β?内酰胺酶编码基因的研究[J].中华医院感染学杂志,2004,14(5):481-486.

[9] 季淑娟,顾怡明,谭文涛.中国部分地区大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌超广谱β?内酰胺酶基因型研究[J].中华检验医学杂志,2004,27(9):590-593.