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RT―PCR在我院手足口病检测中的应用

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摘要:目的 探究rt-pcr技术检测手足口病的准确性,为后期临床监测提供参考。方法 选取我院门诊收入的200例手足口病患儿作为研究对象,随机选取其肠道、、咽拭子样本共320例。使用RT-PCR技术对样本进行定性检测,观察检测结果并进行分析。结果 本研究中检出EV71阳性病毒105例,CoxA16阳性病毒51例,EV阳性病毒11例。两种荧光RT-PCR检测技术结果比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论 RT-PCR技术应用于临床检测手足口病具有重要作用,值得在后期临床中推广及使用。

关键词:RT-PCR技术;手足口病;检测;临床应用

手足口病(HFMD)是儿童中常见的一种传染性疾病,属于我国法定的报告管理型丙类传染病。该症的患者常于口、足、手等部位出现疱疹或皮疹,同时伴有不同程度的发热症状,病情严重者会导致脑炎、神经源肺水肿、无菌性脑膜炎、心肌炎和急性迟缓麻痹等。手足口病的主要致病病毒是肠道71型病毒(EV71)和柯萨奇病毒中A组16型(CVA16)。部分患者在感染手足口病病毒后,病情进展迅速,患者的死亡速度快。手足口病标本采集应尽量在发病3d内完成,咽拭子标本的检出率高于血清标本,为提高标本的检出率,应注意采集技术,提高标本质量[1]。笔者特于2013年1月~2014年1月选取我院收集的320例肠道、、咽拭子样本,应用RT-PCR技术进行研究,取得较好的成效,现将结果总结如下。

1资料与方法

1.1一般资料 选取我院2013年1月~2014年1月由门诊收入的200例疑似手足口病患儿作为研究对象,随机选取其肠道、、咽拭子样本共320例。手足口病的诊断参照我国卫生部2011年修订的手足口病的预防控制指南[2]。其中,重症者112例,非重症者88例;肛拭样本86例,大便116例,咽拭子118例。

1.2方法

1.2.1主要仪器及试剂 选择SLAN实时荧光定量PCR检测仪器、离心机、金属浴等。使用由中山大学达安基因股份有限公司提供的肠道病毒71型核酸检测试剂盒(PCR-荧光探针法)、柯萨奇病毒A16型核酸检测试剂盒(PCR-荧光探针法)。

1.2.2操作方法 提取RNA:由经培训的专业人员严格按照试剂盒的使用说明书对本组320例样本中的RNA进行提取,得到的60 μL经处理后的RNA提取物于零下20℃条件下储存备用。PCR扩增技术:使用核酸荧光PCR的检测混合液15 μL,及酶混合液5 μL,待确认好各种试剂的使用总量后,混匀试剂并分装至20 μL的单支反应管中。分别将5 μL处理完毕的待测RNA样本、阳性及阴性参考品加入20 μL的单支反应管中,每管的最终体积为25 μL。具体反应条件:逆转录反应30 min 50℃,预变性5 min 95℃,后经10 s 95℃和40 s 55℃各45个循环,55℃时使用荧光检测,检测时通道为VIC,ROX,FAM。

1.3观察指标 使用VIC通道检测肠道病毒71型,ROX通道检测肠道通用型病毒,FAM通道检测柯萨奇病毒中A组16型病毒。三者判定条件相同:检测样品的Ct值≥35,呈S型扩增曲线或有显著的指数增长期,则判定为样品中CoxA16/EV 71/EV为阳性;若检测Ct值在35~38,需对样本进行重复检测,若结果相同且呈S型扩增曲线或有显著的指数增长期,则判定为阳性,否则判定阴性;若检测Ct值>38或无数值,则判定为阴性[3]。

1.4统计学处理 数据的收集与处理均由我院数据处理中心专门人员进行,保证数据真实性与科学性。初步数据录入EXCEL(2003版)进行逻辑校对与分析,得出清洁数据采用四方表格法进行统计学分析,分析结果以P

2结果

2.1两种方法的核算检测结果分析 多重荧光技术检测肛拭阳性数70例,单重荧光77例;多重荧光检测大便阳性数103例,单重荧光107例;多重荧光检测咽拭阳性数64例,单重74例,见表1。

2.2症状不同患者的核酸检测结果分析 本研究中检出EV71阳性病毒105例,CoxA16阳性病毒51例,EV阳性病毒11例,见表2。

3结论

手足口病是常见的一种肠道疾病,容易在儿童中感染发展为重症,引起患儿死亡,因此,受到了社会各界及患者家属的高度关注和重视,快速检测对于疾病的治疗和挽救患者生命均具有重要意义。传统检测手足口病病毒的方法是组织培养分离,但该方式具有一定程度的局限性,不适用于临床的常规检测。随着该症的发展,需要一种特异性高,且可快速检测病原的检测方式。

PCR技术是一种快速的检测方式,其被广泛应用于现代的日常检测工作。近年来,具有特异性的荧光探针的PCR荧光技术,不仅可降低扩增产物的污染风险,而且其特异性、灵敏度与检测时间均具有显著的优势。尤其是在检测病毒学病源时,由于培养病毒的条件较难满足,导致其时效性和敏感性较差,而荧光RT-PCR技术则可以较好的解决这个问题。在手足口病的检测中,使用RT-PCR技术通过应用多通道的实时荧光扩增仪,实现了单支管内同时检测CoxA16、EV71及EV这三种手足口病病毒。本次手足口病的核酸检测结果显示,200例研究对象中EV71阳性率为52.5%(105/200),CoxA16阳性率为25.5%(51/200),EV阳性率为5.5%(11/200),表明EV71病毒是手足口病流行的主要病原;其中重症者112例,85例(75.9%)显示为阳性,其病原分布的特征与相关文献报道大致相同。RT-PCR技术的应用,可显著缩短操作时间,缩短了检测周期,提升了工作效率,节约了成本。

本次研究结果显示,多重荧光检测肛拭阳性数70例,单重77例;多重大便阳性数103例,单重107例;多重咽拭阳性数64例,单重74例,多重及单重荧光RT-PCR技术在检测大便、肛拭、咽拭子样本的结果比较,差异无统计学意义(P>0.05)。更好地证明RT-PCR技术应用于临床检测手足口病的重要作用。同时,该项技术的应用显著缩短了操作时间,减少了工作量,节约了成本,尤其对疾病的控制和治疗具有重要意义。

参考文献:

[1]颜玉炳,苏成豪,刘红莲,等.手足口病EV71和CoxA16检出率的影响因素分析[J].厦门市疾病预防控制中心,福建36102,海峡预防医学杂志,2011,17(3).

[2]唐彦,侯俊,徐军,等.实时荧光PCR检测手足口病病原体方法的建立及初步应用[J].中华实验和临床病毒学杂志,2011,25(2):152-154.

[3]叶荣夏,张永乐,潘克女,等.肠道病毒71型与柯萨奇病毒16型病原体检测在手足口病流行中的意义[J].中华医院感染学杂志,2011,21(7):1295-1296.编辑/肖慧