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DNA芯片技术在动物医学中的应用研究

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生物的现象或者形态是由成百上千的基因共同组成的,传统的分子生物学技术不能将全部的基因表达情况测量出来,只能对少数几个基因起作用,要实现大量基因的表达图谱的方式,dna芯片技术就发挥了很大作用。这种生物高新技技术融合了计算机科学、化学、生物信息学等多方面的成就,可以将成千上万的基因片段排列在介质上,能够对基因高效快速的检测,随着DNA芯片技术的发展,将会产生一定的社会效益和经济效益。

一、DNA芯片技术原理

DNA芯片是基于分子杂交基础上的扩展应用,其原理与核酸印迹相差不多,都是利用DNA的双螺旋互补的性质,在寡聚核苷酸链之间形成两个或者三个氢键。DNA芯片的基质材料一般采用尼龙膜、塑料等,在进行试验的时候一般载体的面积约为1平方厘米,然后将特定顺序的DNA单链探针固定在载体上,点布成千上万的DNA,将芯片与标记的待测DNA或者RNA进行杂交,被检测物一般都用荧光染料或者生物素标记。在杂交过程中,探针会产生杂交信号,杂交信号的强弱代表了碱基因配对正确性。杂交过程完毕后,通过激光共聚焦显微镜进行试验扫描,然后用计算机软件分析杂交结果,将杂交信号划分等级并获取分布模式图。根据结果的分析可以反映出样品中基因表达的情况,对于探针的样品量可以相对应的计算出来。一张DNA芯片上探针的数量与芯片的设计与制作方法有很大的关系,一般都是采取在一张芯片上杂交两种样本,这样可以避免不同芯片产生的误差。

二、DNA芯片技术在动物医学中的应用

1、基因表达谱的研究应用

基因表达谱是DNA芯片中研究最为广泛且很成熟的一种技术。传统的基因检测只能了解到极少数的基因表达情况,而DNA芯片上可以承载数以万千的探针,这样就可以将数量多的基因同时检测出来,转录水平不受基因和条件的限制,可以对比不同条件下的一个基因组的转录情况,也可以将不同基因组的转录情况对比出来,这是研究病原微生物全新的里程碑。在基因表达图谱上有着不同的应用,比如在热休克状态下枯草芽胞杆菌的表达图谱,可以观察出有将近100多个的上调基因。signaB和Hrcb共同对热休克进行调控子控制,大部分是前者的控制,通过对受控基因的分析可以预测出70多个新的调控子成员。在大肠杆菌中过氧化氢应激的表达图谱中,通过对诱导表达基因的控制,将OxyR与野生型的基因变异体进行比较,证实了过氧化氢诱导表达基因大部分都是有OxyR引起的,同时在比较的过程中还发现了几个新的OxyR激活基因,但是有些诱导基因是属于非依赖型的,说明在大肠杆菌中还受其他的调控因子的控制。

2、病原微生物检测的应用

DNA芯片在医学上有诊断以及检测的功能,随着对DNA芯片技术的不断研究,针对各种病原体的DNA芯片已经市场化,比如在人类医学上DNA芯片技术有着广泛的应用,在艾滋病病毒的检测上就可以通过DNA芯片技术中所发明的HIV芯片。但是在动物医学生还没有将市场打开,好多动物病原体的芯片测试还在研发,还处于试验阶段,现在利用动物病毒的保守基因的部分片段,用芯片点样放到载体玻璃上,然后把这部分基因制作成具有检测功能的芯片,用荧光标记提取的动物DNA或RNA的变异样品,通过与芯片的融合进行杂交试验,然后对杂交结果进行分析。此种方法具有快速、高效、准确的特点,而且对于多种病毒能够同时进行检测,所以在实际应用中解决很多种动物的疾病。

3、细菌分型的应用

DNA的芯片技术可以对基因组的变异DNA或者RNA的遗传特性进行分析,从而可以将细菌中的遗传距离或者菌体的毒性特征能够计算出来,有利于将细菌类别判断清楚。比如在试验中有11种致癌基因,建立相应的细菌基因组芯片,然后与这些致癌基因的DNA进行杂交,扫描分析后检测出被测的致癌基因中有20%左右没有显示杂交信号。这说明在被检测的细菌基因组出存在一定的差异性,所以出现了这种情况。在区分24种单增李氏菌的不同血清型中也建立了一种基因组芯片,通过致病菌基因与芯片杂交,可以很明确的区分致癌菌与非致癌菌之间的基因差异,然后筛选出多种差异基因。这种技术在大规模的基因筛选中应用很广泛,随着技术的拓展可以发挥到细菌治病分子机制的研究当中。

4、基因突变和多态性检测的应用

DNA芯片技术能够准确的检测出分子突变的位置和类型,突出了DNA芯片技术在核酸点以及基因序列中的重要作用,能够进行单数基因或者整个基因组的突变检测。在利用DNA芯片检测技术中能够准确的监测中乙肝病毒中突变的位点,对于病毒的变异情况也能够检测出来。在实际应用中具有简单、快捷、准确的特点。

5、病原微生物基因组学研究的应用

随着在科研中越来越多的基因组被表达出来,在微生物研究中基因组学已经成为热点话题。在比较基因组学中可以将更多的基因信息扩展出来,为以后的基因验证工作奠定了坚实的基础。比如在不同菌株比较致命菌的基因组序列中,可以将致命基因全部表达出来,更可以推断出一些与致命力有关系的基因组序列。在进行基因组测序工作时,需要有大量的投资,所以利用DNA芯片将已经表达出来的基因组序列制备出涵盖面更广的基因组信息,可以满足对全基因组的需求。

三、DNA芯片技术应用展望

基因芯片技术在应用中仍然存在很多问题,例如在核酸杂交反应中操作方法比较复杂,反应的特异性灵敏度不能满足要求,在标记过程中延迟了试验时间,而且耗资过多。在基因芯片上很多的基因的功能可以推测出来,但是还有部分的基因功能不能够研究清楚,所以在试验中尽管基因发生了变化,但是也不能具体的了解这种生理和病理的变化。

随着基因芯片技术迅猛的发展,技术手段也不断的成熟起来,基因芯片在基因测序、多态分析、文库筛选以及病原诊断等领域有着广泛的应用前景。而且在动物医学、药物研制、检疫、食品工程等方面也有着巨大的应用价值。所以基因芯片技术在人类的科研中创造的巨大的价值。

总而言之,随着基因芯片技术的不断发展,在医学的各种领域上得到了广泛的应用,但是在实际应用中存在很多的问题,所以要不断的完善基因芯片技术,使其在生命科学领域中有着更广阔的应用空间。

参考文献:

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[2]沈红,李焕荣,陈葵,马俊云,吴国娟.生物芯片技术在药理学和毒理学研究中的应用[J].北京农学院学报;2004年04期1期

[3]杨林,廖明.动物疫病基因芯片诊断技术的研究进展[J].黑龙江畜牧兽医;2006年09期