首页 > 范文大全 > 正文

利用同功酶研究新疆狗牙根的遗传多样性

开篇:润墨网以专业的文秘视角,为您筛选了一篇利用同功酶研究新疆狗牙根的遗传多样性范文,如需获取更多写作素材,在线客服老师一对一协助。欢迎您的阅读与分享!

摘要:利用过氧化物酶同功酶(POD)、酯酶同功酶(EST)、超氧化物歧化酶(SOD)、酸性磷酸酯酶对7份新疆狗牙根材料遗传多样性進行检测,结果表明:供试材料同功酶多样性程度高,4种同功酶中,EST同功酶的多态性最高,可良好区分新疆狗牙根种内不同生态型;同功酶酶谱的聚类分析结果与外部形态并无绝对相关性。

关键词:新疆狗牙根;同工酶;电泳;遗传多样性

狗牙根为多年生草本植物,世界上分布极广,具有丰富的遗传变异,是宝贵的草坪草种质资源。新疆狗牙根具有较强的抗寒性、抗旱性、耐盐性、抗热性、抗病虫害等特性,因此,在草坪生产中受到广泛重视。为了更好利用资源,需对其遗传多样性進行研究。在检测狗牙根种质资源遗传多样性中,由于杂交、多倍体无融合生殖使植物形态特征变得模糊,同功酶作为一种稳定的遗传标记,是经济有效的方法。Dabo等用PAGE凝胶电泳法检测出不同狗牙根品系的同功酶差异性。刘建秀等用酯酶同功酶对华东地区野生狗牙根的遗传变异進行研究,发现居群内变异大于居群间变异。王赞,毛凯等对攀西地区野生狗牙根资源進行形态和同功酶水平研究,表明不同居群蛋白质图谱与地理分布和生境条件有一定关系,过氧化物酶同功酶作为遗传标记,可用于攀西地区狗牙根种以下单位亲缘关系和遗传多样性研究。对于新疆狗牙根的研究多侧重于外部形态方面。本研究拟通过4种同工酶对7份新疆狗牙根材料遗传多样性進行研究。

1.材料与方法

1.1试验地概况

试验地为新疆农业大学试验场,位于乌鲁木齐市,海拔850m,年均温度6.5℃,年极端最高温度38.8℃,年极端最低温度-41.5℃冬季有积雪,年降水量230mm,,年蒸发量2570mm。土壤冻结期11月中旬,解冻期3月中旬,无霜期150天左右。试验地前作为种植3年的牧草,土壤为荒漠灰钙土,肥力中等,有灌溉条件。

1.2试验材料及种植方法

7份供试材料分别为:新农一号狗牙根、喀什狗牙根和新农二号狗牙根,新疆农业大学选育的4份新疆狗牙根材料,即新疆狗牙根C2、新疆狗牙根C3、新疆狗牙根C4、新疆狗牙根C5,于2002年7月11日利用根茎营养繁殖体進行穴播,采用随机试验设计。

1.3试验方法

同工酶电泳参照郭尧君等的方法,同工酶染色参照何忠效、王中仁等的方法并做了相应的改动。随机抽取直立茎顶部倒数第3片叶片,每个小区取样数10个。每0.2g叶片约加700μL提取液(ddH2O),冰浴研磨,9000r/min、4℃离心机中离心15min,取上清,加入等体积的上样缓冲液(20%蔗糖+0.1%溴酚篮)并混匀,置于4℃条件下保存备用。

4种同功酶电泳均采用不连续性垂直板聚丙烯酰胺凝胶电泳,分离胶的浓度为10%,浓缩胶的浓度为4%。其电极缓冲液都为Tris-甘氨酸缓冲系统(Tris),电泳时上样量均为30μL。160V恒压电泳约2.5h,当前沿指示剂距胶板底部约1cm时停止电泳,之后進行染色。

1.4数据处理

将酶谱中的酶带按照其特征和相对最大迁移率命名、分区,并将具有多态性的谱带有带的量化为1,无带的量化为0,计算新疆狗牙根材料遗传相似系数,同时对供试材料進行酶谱带数的统计及多态性研究。采用类平均法(Unweighted pairgroup method affthmetic average)对相似系数矩阵進行聚类分析,聚类结果中的树状图是根据欧式距离進行分类分析。所有数据统计由DPS v2.00统计软件完成。各酶条带的最大迁移率(Rf):Rf=X2/X1,其中:X2——染色后酶条带的迁移距离;X1——染色后溴酚蓝指示剂的迁移距离。

2.结果与分析

2.1同功酶多态性分析

供试材料4种同功酶电泳酶谱显示出较为丰富的多态性差异(见表1)。由此可以看出,EST产生的总条带数最多,且产生的多态性条带数也最多;POD与酸性磷酸酯酶总条带数略不同,但两者的多态性条带数相同;SOD产生的总条带数和多态性条带数均最少。因此可知,4种同功酶的多态性大小为:EST>酸性磷酸酯>POD>SOD。

2.2同功酶酶谱特征分析

2.2.1过氧化物酶同功酶酶谱结构及特征分析。电泳检测表明,7份新疆狗牙根材料的POD酶谱可分为A、B 2个区(由阴极到阳极),A区每份材料都有2条强带,最大迁移率分别为3.64%、7.27%;A区除新农一号狗牙根有2条带,其余材料均有3条带。B区,迁移率12.7%位点的强带是新农二号狗牙根过氧化物酶的特征带之一;迁移率19.1%位点的谱带是新疆狗牙根C2过氧化物酶的特征带之一。

2.2.2酯酶同功酶酶谱结构及特征分析。EST酶带可明显分为A、B、C3个区(由阴极到阳极)。在A区(迁移率0.0%~12.73%)中只新疆狗牙根C2,新疆狗牙根C3分别在迁移率6.36%和12.73%两位点处呈现2条谱带,其它材料仅在迁移率12.73%有1条谱带;B区(迁移率20.0%-29.1%)中,除新疆狗牙根C2、新疆狗牙根C5外其余材料均有1条带,迁移率25.45%位点的谱带是新农二号狗牙根EST的特征带之一;迁移率29.10%位点的谱带是新疆狗牙根C2酯酶的特征带之一;C区(迁移率32.73%~38.18%)中,迁移率32.73%位点的谱带是新疆狗牙根C4酯酶的特征带之一。

2.2.3酸性磷酸酯酶同功酶酶谱结构及特征分析。电泳检测表明,7份新疆狗牙根材料的酸性磷酸酯酶同功酶酶谱可分为A、B2个区(由阴极到阳极)。A区在迁移率7.27%处,仅新农二号狗牙根、新疆狗牙根C2有1条带。B区(迁移率20.0%-31.82%)中,迁移率25.45%位点的谱带是新疆狗牙根C4酸性磷酸酯酶的特征带之一。喀什狗牙根和新疆狗牙根C2的最大迁移率明显较小,分别为2.7%,7.3%;其余材料最大迁移率均在20%-31.8%之间。

2.2.4超氧化物歧化酶同功酶酶,谱结构及特征分析。电泳检测表明,7份新疆狗牙根材料的SOD酶谱可分为A、B、C3个区(由阴极到阳极)。在A区(迁移率0.0%-6.36%)中,有1条带,是新农二号狗牙根SOD的特征带之一;在B区(迁移率21.82%~34.55%)中,新疆狗牙根C4、新疆狗牙根C5、喀什狗牙根有3条带,其余材料均有2条带。在C区中,在迁移率为60.0%处,只有新疆狗牙根C5和新农一号狗牙根有1条带。从以上分析上看,7份新疆狗牙根材料的4种同功酶谱在酶带数量(见表2)、迁移率和表达量上表现出差异,显示了其遗传上的多样性。

2.3新疆狗牙根材料同功酶谱带的聚类分析

基于4种同功酶酶谱相似系数的聚类结果见图1,在遗传相似距离2.21处将7份新疆狗牙根材料分成4类:新农一号狗牙根、新农二号狗牙根均单独为一类,新疆狗牙根C2、新疆狗牙根C4和喀什狗牙根聚为一类;新疆狗牙根C3和新疆狗牙根C5聚为一类。

新疆狗牙根C2与新疆狗牙根C4同功酶酶谱相似性强,说明这2份材料的遗传差异较小,亲缘关系较近;新疆狗牙根C3与新疆狗牙根C5同功酶酶谱相似性强,说明这2份材料的遗传差异较小,亲缘关系较近。新农一号狗牙根、新农二号狗牙根与其它供试狗牙根材料同功酶酶谱差异较大,分别单独为一类,说明与其它供试狗牙根的遗传差异较大,亲缘关系较远。

3.讨论与结论

从形态学或表型上检测遗传变异是最古老也最简便易行的方法,能够明确显示遗传多样性的外观性状,但许多形态标记的遗传表达有时不太稳定;同功酶是基因表达的产物,与形态性状相比,受环境的影响较小,分析所需材料少,试验技术简单,结果易于比较,但它是基因表达的产物,受植物生育阶段、环境条件等的影响,反映出来的遗传多样性的稳定性和准确性较DNA水平的多态性逊色一些。对7份新疆狗牙根材料生物学特性、坪用性以及环境适应性(越夏、抗病虫害、越冬率)等方面已作了相关试验研究。新疆狗牙根C3和新农一号狗牙根形态相似性强,但谱型差异较大,说明形态与同功酶谱型并无绝对相关性。新疆狗牙根C4和喀什狗牙根形态相似性强,同功酶酶谱型较相似,表现极强同源性。新疆狗牙根C5和新疆狗牙根C3外形相差较大,但同功酶酶谱型相似性强,说明尽管生态适应使狗牙根的外型发生变化,但还未涉及到控制蛋白质合成的基因位点发生变化。供试狗牙根广泛分布于新疆南北疆平原绿洲地区,形态相差较大,谱型具有多型性,但基本谱型相同,说明其遗传变异是等位基因差异造成的。4种酶中,EST同功酶的多态性最高,可良好区分新疆狗牙根种内不同生态型。同功酶是基因的产物,但终归只是基因的表现型而不是基因型。还不能真正从基因水平检测遗传多样性。因此,在用同功酶检测植物遗传多样性时,还应结合更加精确的DNA分子标记(如RAPD,RFLP,AFLP等等)共同進行,才能更完整的反映供试材料的遗传多样性。