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临床荧光定量PCR检测中问题及原因分析

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随着定量pcr商品试剂盒的推出,目前国内很多医疗机构开展了病原体核酸检测,但PCR反应最大的特点是具有较大扩增能力和极高的灵敏度,稍有不慎即可引起检测结果较大的差异和极微量的污染,即可造成假阳性。

1 检测结果差异大

PCR检验操作主要是标本处理中的核酸提取步骤,其中涉及的主要是移液器的使用,尽管操作简单,但均为微量操作。目前国内所使用的Taqman荧光定量PCR测定技术均为外标定量方法,PCR反应体系小的区别也会对扩增效率造成较大的影响,从而使模板定量测定精密度和重复性不佳,从实际工作来看,不同操作者所测的结果差异较大,强调样本核酸提取的标准化,核酸提取不规范、不准确,后面的扩增和定量测定等于零。可通过操作者有计划的培训,强化实验技能,不同操作者平行性检测比对,室内质量控制,室间质量评价来达到自我教育作用,从而提高整体试验质量。

2 污染

PCR检测的污染主要来自3个方面,第一方面是样本间交叉污染,包括收集容器被污染或标本放置时由于密封不严

作者单位:671000云南省大理州人民医院检验科

溢于容器外,或容器外有标本而造成相互间的交叉污染;样本核酸模板在提取过程中高温加热时崩盖形成气溶胶污染;移液器污染导致标本间的污染。第二方面是PCR试剂的污染,包括PCR试剂配制过程中由于移液器、容器、双蒸水及其他共用溶液被PCR核酸模板污染。第三方面是PCR扩增产物的污染,包括在对扩增产物操作时比较剧烈摇动扩增管,开盖吸样时及用污染移液器的反复吸样都可引起污染。实时荧光定量PCR检测实现了扩增管的闭管检测,最大程度上避免了扩增产物的污染。临床PCR室污染监测可通过设置对照试验来达到目的,包括:①阳性对照:它是PCR反应是否成功、产物条带位置及大小是否合乎理论要求的一个重要参考标志;②阴性对照:强调PCR实验每次必须做阴性对照且包括:a、标本对照:用鉴定后的正常血清作对照,监测实验室以前扩增产物污染,由实验操作所致的标本间的交叉污染和扩增反应试剂的污染;b、水对照:以水为模拟标本经历整个核酸提取过程,功能同标本对照,但对污染的反映更灵敏;c、试剂对照:仅含PCR试剂不加任何DNA或RNA模板直接进行PCR扩增,以监测扩增试剂是否发生污染,具有较强的污染鉴别性;③重复性试验。